1991年5月，由铁道部和安徽省共同投资建设的合九铁路正式开工。

1995年，桐城站建成。

1996年1月，合九全线竣工交付验收，开办了跨局客运和全路货物直通运输业务，由上海局控股的合九铁路有限责任公司负责经营管理，桐城站属之。

2005年3月，全路裁撤铁路分局建制实行站段直管，桐城站属上海铁路局合肥车务段管辖，现为三等站。

2020年6月20日起，桐城站实施电子客票。

客运：办理旅客乘降；行李、包裹托运；

货运：办理整车货物发到。

桐城站站场规模为2台3线，设侧式站台和岛式站台各1座，正线1条，到发线2条，途经桐城站线路为合九铁路。

桐城站

乘客可乘坐桐城公交1路和桐城公交1路晚班到达桐城站或从桐城站前往市区。

运营时间：6:00-18:00 票价：1-2元

综合客运枢纽站—新瑞集团—交警大队—南关邮局—和平花园—和平菜市场—金元商厦—新华书店—市民广场—滨河公园—红星路口—太阳城—自来水公司—体育场—盛唐广场—法院—东苑新村—火车站

桐城公交1路晚班：综合客运枢纽站←→火车站

运营时间：18:00-21:00 票价：1-2元

综合客运枢纽站—第二水厂—公安局—为民服务中心—时代广场—碧峰小区—桐城师范—龙安广场—市民广场—滨河公园—金满楼—建行大厦—自来水公司—体育场—盛唐广场—法院—东苑新村—火车站

2021年1月20日起执行